MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella baltica OS155 plasmid pSbal04

Total Repeats: 38

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009038	ACC	2	6	104	109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_009038	AAT	2	6	118	123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009038	T	6	6	172	177	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009038	CTTT	2	8	482	489	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_009038	TC	3	6	571	576	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_009038	AC	3	6	622	627	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_009038	AT	3	6	667	672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009038	AGCA	2	8	734	741	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_009038	TAT	2	6	819	824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009038	ATT	2	6	831	836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009038	AGCGT	2	10	856	865	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_009038	ACTT	2	8	932	939	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_009038	CA	3	6	1007	1012	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_009038	TGT	2	6	1104	1109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009038	CTAA	2	8	1331	1338	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_009038	AAT	2	6	3466	3471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009038	TCAA	2	8	3481	3488	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_009038	TGT	2	6	3508	3513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009038	GTT	2	6	3562	3567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009038	TTTA	2	8	3574	3581	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009038	CA	3	6	3601	3606	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_009038	ATT	2	6	3994	3999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009038	T	7	7	4044	4050	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009038	ATTT	2	8	5920	5927	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009038	T	7	7	6001	6007	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009038	T	6	6	6023	6028	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009038	CATTT	2	10	6041	6050	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_009038	TAT	2	6	6095	6100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009038	TTA	2	6	6111	6116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009038	TGC	2	6	6160	6165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_009038	TA	3	6	6293	6298	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009038	AT	3	6	6316	6321	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009038	CG	3	6	7711	7716	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_009038	GC	4	8	7732	7739	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_009038	ATT	2	6	7776	7781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009038	ATTT	2	8	7812	7819	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009038	T	8	8	7856	7863	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009038	GCA	2	6	7963	7968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.